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“云上黑山羊”基因身份证和50K育种芯片研发成功
提高黑山羊精准育种水平和育种效率
文章字数:679
  
  记者近日从云南省科技厅了解到,云南省畜牧兽医科学院羊产业技术研发与应用创新团队成功研发出“云上黑山羊基因身份证”和“云上黑山羊50K育种芯片”,可用于“云上黑山羊”的精准鉴定,并提高其精准育种水平和育种效率。研发成果将为规范“云上黑山羊”种羊推广、提高种质价值、开展持续选育提供技术支撑,助推云南省肉羊产业高质量发展。
  为鉴定“云上黑山羊”纯种,有效开展种业市场监管,维护其品牌价值,云南省畜牧兽医科学院研究团队对我国南方主要的4个黑山羊品种(类群)160只个体进行深度基因组重测序获取各品种特异性位点后,对3072个样本进行分型检测,借助机器学习方法建立了“云上黑山羊”鉴定模型并完成模型的优化,挖掘出能够作为纯种“云上黑山羊”基因标识鉴定的26个SNP位点,最终研发出“云上黑山羊基因身份证”。目前该基因身份证鉴定成功率达90%,是国内唯一开展“云上黑山羊”品种鉴定的试剂盒。
  “云上黑山羊50K育种芯片”基于山羊通用芯片功能位点,融合了74个“云上黑山羊”繁殖性状、生长性状和基因身份证的功能位点共计50000个SNP位点,平均检出率可达98.77%,分型一致性可达99.30%,相较于通用芯片检测成本降低了三成。该芯片不但可用于“云上黑山羊”全基因组选择育种、重要经济性状功能基因挖掘,还可用于云南本地山羊种质资源创新利用与保护、亲缘关系鉴定等,是目前国内唯一一款“云上黑山羊”育种芯片,相较通用芯片,在降低分子育种成本、提高选种准确率方面优势明显。
  据悉,“云上黑山羊”是由云南省畜牧兽医科学院联合省内多家单位历时22年培育的我国第一个肉用黑山羊新品种。2023年6月,该品种被农业农村部列为全国主导品种。(据《云南日报》)

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