农业的源头在种子，种子的基础在科技。种业是一个系统性和集约程度较高的行业，不但涉及到作物遗传学、分子生物学和作物育种学等多个生物学科外，还和种子加工与贮藏、作物栽培、作物保护和作物机械化生产等多个领域具有不可分割的关系。在促进种业科技创新之前，必须坚持几个基本原则。
　　第一，种业科技创新必须结合我国农作物产品领域的主要矛盾，着眼农业供给侧改革。随着人们生活水平的提高，对农产品品质的要求备受重视，而我国生产的农产品品质偏低，多样化程度低，优质农产品存在巨大产需缺口，高端优质专用产品供给不足。另一方面，农村劳动力急剧减少、生产成本急剧上升，实现农业生产机械化和轻简化成为大势所趋。然而，玉米、棉花、油菜等作物缺乏适宜机械化作业新品种。
　　第二，种业科技创新必须和种业产业的发展紧密结合。在市场经济体制下，要明确种业科技创新领域的公益性研究由国家科研机构和大学为创新主体，而竞争型产品研发以企业为创新主体，从而打破公共科研部门利用公共资金和公共资源参与竞争型产品研发的垄断地位，并促进源于公共科研部门的基础科研成果向企业流通的局面。
　　第三，种业科技创新必须认清当前农业生物前沿技术的发展特点。现代育种是建立在孟德尔遗传学理论的基础之上，经过了100多年的逐步发展，到今天呈现井喷式发展：基础研究领域的成果已经成为驱动农业生物种业发展的创新源泉，前沿关键技术快速突破推动种业进入新一轮技术革命，种业品种研发呈现多元化的发展态势。如何充分认识和利用当今的农业前沿技术，是我国种业实现弯道超车的关键一环。