大水漫灌引起果树根死亡　果树大量的吸收根都分布在根际30厘米以上的表层土壤。这些根系称得上是果树的命根子，对环境变化非常敏感，表层土壤的变温、干旱、洪涝等都会造成其死亡。研究表明，大水漫灌后，由于表层土壤的通气性、温度、含水量等发生很大变化，处于表层土壤的吸收根往往大量死亡。而这些根系的死亡，会造成果树营养的暂时亏缺，直到新的吸收根长出来，所以，一些果树经过大水漫灌后，会出现叶片发黄或者落果等现象。
 　 大水漫灌会造成土壤板结  大水漫灌对土壤侵蚀、压实的作用很强，大水漫灌使得土壤内的空气被挤出，土壤处于一个缺氧环境，一些根系和土壤微生物会因为缺氧死亡，土壤的团粒结构也被破坏，造成土壤板结。
　　大水漫灌会推迟水果成熟特别是春季，由于水的比热很大，果园大水漫灌后地温升高缓慢。温度低，会直接影响果树根系的生长和土壤微生物的活动，推迟果树的开花时间，进而推迟果实的成熟时间，尤其对中早熟品种影响较大。
　　大水漫灌容易传播病害　腐烂病等许多病菌都是随水传播，果园大水漫灌后，腐烂病菌等多种病菌就会随水流到每一棵果树的根茎部位，条件适宜就会侵染健康果树，造成腐烂病的流行。
　　大水漫灌引起果树旺长 难成花大水漫灌后，果树由于吸收过多的水分，营养生长大大增强，大量冒条，新梢旺长。新梢的旺长，会消耗过多的光合营养和矿质营养，分配到果实、根系、花芽的营养就会相对减少，果实难以长大、花芽难以形成、根系生长受到抑制。同时，新梢过度旺长，营养积累变差，枝条不充实，无效枝叶增多，光能利用率降低，各种病虫害容易流行。
 　 大水漫灌造成水分养分浪费　据调查，大水漫灌一亩果园大概需要120多吨水，而采用节水灌溉技术，可以节省75%以上的水，抛开国家层面来说，对果农个人来说，这是一笔不小的开支。另外，土壤中的一些矿质营养会随着大水流失或者下渗到深层土壤中，造成养分的极大浪费。