草甘膦是甘氨酸类。
   作用机理院抑制烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，蛋白质合成受阻；草甘膦为内吸传导型广谱灭生性除草剂，通过茎叶传导到地下部，对深根杂草的地下组织破坏力强，能达到一般农业机械无法达到的深度。
    草铵膦是膦酸类。
    作用机理院积铵触杀，抑制谷氨酰胺合成。草铵膦为膦酸类非选择性传导型除草剂，通过抑制谷氨酸合成酶这一植物的重要解毒酶作用，导致植物体内氮代谢紊乱，铵过量积累，叶绿体解体，从而使植物光合作用受抑制，最终导致杂草死亡。
    除草效果不一样
    草甘膦一般要7～10天见效；
    草铵膦一般为3天（正常气温）。
    从除草速度、除草效果、控制杂草再生时期等方面看，草铵膦的田间表现都很优异，随着草甘膦、百草枯的抗性杂草越来越严重，农民会因草铵膦卓越的防效，及良好的环保性能而很易接受。对生态要求更安全的茶园、农场、绿色食品基地等，对草铵膦的需求也越来越大。
    除草范围不同
    草甘膦对160多种杂草有防除作用，包括单子叶和双子叶、一年生和多年生、草本和灌木等植物，但它对部分多年恶性杂草防除效果不理想。对抗性恶性杂草如牛筋草、小飞蓬等，草甘膦效果不是很明显；草甘膦一般不能用于浅根或根系暴露在外的作物如香菜、胡椒、葡萄、木瓜等。
    草铵膦为广谱、触杀型、灭生型、非残留除草剂，使用范围很广，草胺膦可以用在所有作物（只要不喷到作物上即可，行间施药要加装盖或罩）。采用杂草茎叶定向喷雾处理，几乎可以用于宽型种植的果树、中耕作物、蔬菜和非耕地的杂草防除；能快速杀死100种以上的禾本科和阔叶杂草，特别是对耐受草甘膦的部分恶性杂草如牛筋草、马齿笕、小飞蓬等效果非常好，成为禾本科与阔叶杂草的克星。（单采妮）